El projecte de Ràdio Capital va començar l'abril de 2001 quan l'empordanès Miquel Curanta i un grup de joves gironins, que estaven treballant en emissores de Barcelona, van engegar una radiofórmula musical que, a més, contenia càpsules informatives d'interès per una audiència juvenil, a l'emissora municipal Ràdio Sant Boi, de Sant Boi de Llobregat.
Aquell projecte va esdevenir Ràdio Capital de l'Empordà l'any 2007, una emissora sense ànim de lucre, amb seu a Pals i estudis a la Bisbal d'Empordà. Inicialment, va funcionar des de la casa de Miquel Curanta, amb l'ajuda tècnica de Juli Pedrero. Posteriorment, va estar a la mateixa seu que Ràdio La Bisbal. Ràdio Capital formava part d'una associació anomenada Acció per a la divulgació cultural de Catalunya, amb seu a Pals.
Posteriorment, l'entitat que la gestiona és l'Associació Escola de Ràdio i Periodisme Digital de l'Empordà. Fan tallers pràctics de ràdio i periodisme digital. També gestionen el portal informatiu radiocapital.cat.
L'Ajuntament de La Bisbal va destinar una partida del pressupost de 2019 per a nou equipament per la ràdio municipal i per recuperar la programació local. La coordinació de les obres dels nous estudis de Ràdio Bisbal les va fer Ràdio Capital. Els estudis de l'emissora municipal, a la primavera de 2020, van passar a estar a l'edifici de l'antic ajuntament. Els nous estudis es van acabar el mes de juliol de 2020 i durant aquell estiu algun programa de Ràdio Capital es va fer des d'aquells estudis ubicats a l'edifici de l'ajuntament vell de La Bisbal d'Empordà.
El 22 de maig de 2021, Ràdio Capital va inaugurar un nou estudi amb el nom de Juli Pedrero, situat al Centre Cavallers, de Palafrugell.
